截至2022年11月，理学院共有党员211名，党支部11个，其中教工党支部5个，学生党支部6个。 应用物理系党支部是上海市教卫工作党委“先进基层党组织”，2022年获批创建“上海党建工作样板支部”。
教工党支部：
| 党支部名称 | 党支部书记 | 副书记 | 组织委员 | 宣传委员 | 纪检委员 |
| 数学系支部 | 罗旻杰 | / | 申冉 | 王珂 | 王珂（兼） |
| 统计系支部 | 康剑灵 | / | 葛勇 | 谢臻赟 | 葛勇（兼） |
| 应用物理系支部 | 陆爱江 | 杨沁玉 | 苗晓莉 | 杨唯 | 吴华 |
| 光电科学与工程系支部 | 杨馥 | / | 梁源 | 姜萌 | 姜萌（兼） |
| 力学、院办支部 | 韩志林 | / | 李瑞雪 | 黄晖 | 李瑞雪（兼） |
学生党支部：
| 党支部名称 | 党支部书记 | 副书记 | 组织委员 | 宣传委员 | 纪检委员 |
| 数学系本科党支部 | 王梦竹 | 夏文欣 | / | / | / |
| 物理系本科党支部 | 马雷斯 | 詹海月 | / | / | / |
| 数学系研究生党支部 | 卢文芸 | 余锞 | 盖子若 | 陆淑颖 | 张莹 |
| 物理系研究生党支部 | 张佳 | 刘力瑞 | 王佳怡 | 陈兴旺 | 郑新立 |
| 专硕党支部 | 吴智笙 | 叶冰清 | 李润通 | 徐如芸 | 卫彩萍 |
| 统计系本科党支部 | 孙奉天 | 吴婷 | 潘长伟 | 钱爽 | 益西央宗 |